Identificación de polimorfismos obesogénicos en mexicanos / Identification of obesogenic polymorphisms in Mexicans

Introducción. La obesidad es una enfermedad metabólica caracterizada por el aumento del índice de la masa corporal. El riesgo de obesidad depende de factores ambientales, del estilo de vida y de la presencia de variantes genéticas originadas por mutaciones únicas y polimorfismos de un solo nucleótido (SNPs). Estudios han mostrado la importancia de la etnia en la heredabilidad de las variantes genéticas asociadas al desarrollo de la obesidad. En México, la prevalencia de sobrepeso y la obesidad es del 38.8 % y 32.4 %, respectivamente. Objetivo. El objetivo de este estudio es determinar SNPs que influyen de manera distintiva en el desarrollo de la obesidad de mexicanos. Materiales y métodos. Se realizó un estudio bibliográfico en la base de datos Pubmed con 70 artículos que estudian la asociación de diferentes SNPs con el desarrollo de la obesidad en mexicanos. Resultados. Se identifican los SNPs rs17782313 (MC4R), rs6548238 (TMEM18), rs6265 (BDNF) y rs7488665 (SH2B1) con un comportamiento diferencial respecto a los resultados obtenidos en población caucásica y el SNPs rs6232 del gen PCSK1 asociado con la aparición de la obesidad en edades juveniles en la población mexicana. Conclusiones. Concluyendo que la caracterización detallada de los genes de mayor incidencia en las distintas etnias contribuye a establecer estrategias personalizadas en particular de la población mexicana y que permitan desarrollar un sistema de alta sensibilidad para determinar la susceptibilidad a la obesidad(AU)

Introduction. Obesity is a metabolic disease characterized by an increase in the body mass index. The risk of obesity depends on environmental factors, lifestyle and the presence of genetic variants caused by single mutations and single nucleotide polymorphisms (SNPs). Studies have shown the importance of ethnicity in the heritability of genetic variants associated with the development of obesity. In Mexico, the prevalence of overweight and obesity is 38.8% and 32.4%, respectively. Objective. The objective of this study is to determine SNPs that have a distinctive influence on the development of obesity in Mexicans. Materials and Methods. A bibliographical study was carried out in the Pubmed database and 70 papers were found that study the association of different SNPs with the development of obesity in Mexicans. Results. The SNPs rs17782313 (MC4R), rs6548238 (TMEM18), rs6265 (BDNF) and rs7488665 (SH2B1) with a differential behavior with respect to the results obtained in the Caucasian population, and the SNPs rs6232 of the PCSK1 gene associated with the appearance of obesity in youth in the Mexican population. Conclusions. Concluding that the detailed characterization of the genes with the highest incidence in the different ethnic groups contributes to establish personalized strategies in particular of the Mexican population and that allow the development of a highly sensitive system to determine susceptibility to obesity(AU)

On the genetic determinants of hypovitaminosis D

Hypovitaminosis D, defined by low serum levels of 25(OH)D, is a recognized worldwide public health problem. The most accepted definition considers that deficiency occurs with serum levels fall below 12 ng/ml of 25(OH)D. Long term vitamin D deficiency results in decreased bone mineralization, secondary hyperparathyroidism, increased cortical bone loss (pathogenesis of osteoporosis and hip fractures), differentiation and division of various cell types, muscle strength, diabetes type 2, blood pressure, etc. Twin- and family-based studies indicate that genetic factors influence serum 25(OH)D levels. Genetic studies have shown single-nucleotide polymorphisms (SNPs) are linked to low serum 25(OH)D concentrations through changes in the activity of the enzymes of the 1α,25(OH)2D metabolic pathway. Carriers of high genetic risk scores would need a h igher amount of vitamin D supplementation to achieve adequate serum 25(OH)D concentrations. Clinicians would not need to indicate studies to identify patients with vitamin D insufficiency of genetic origin. They should instruct their patients on their own care, to control the intake of vitamin D and the serum 25(OH)D levels until the latter are adequate. Overall, the literature reveals that the consequences of hypovitaminosis D on bone health are observed in old and infrequently in young subjects. A probable explanation for the latter is: if the rate of bone remodeling allows it, bone tissue has endogenous (genetics, hormones) and exogenous determinants (diet, physical activity) that may compensate the variables of bone health. The consequences of vitamin D deficit on bone health, has not been completely uncovered.

La hipovitaminosis D, definida por bajos niveles séricos de 25(OH)D (<12 ng/ml), es un reconocido problema de salud pública mundial. La deficiencia de vitamina D a largo plazo resulta en una disminución de la mi neralización ósea, hiperparatiroidismo secundario, pérdida de hueso cortical (patogénesis de la osteoporosis y fracturas de cadera), diferenciación y división de varios tipos de células, fuerza muscular, diabetes tipo 2, pres ión arterial, etc. Estudios genéticos han demostrado que algunos "polimorfismos de un solo nucleótido" (SNP) están relacionados con bajas concentraciones séricas de 25(OH)D a través de reducción en la actividad de las enzimas implicadas en la síntesis de 1α,25(OH)2D. Los médicos no necesitan indicar un estudio genético para identificar a la insuficiencia de vitamina D de causa genética. Bastará con instruir a los pacientes sobre su propio cuidado y controlar la ingesta de vitamina D y los niveles séricos de 25(OH)D hasta que estos últimos sean adecuados. En general, la literatura revela que las consecuencias de la hipovitaminosis D sobre la salud ósea se observan en las personas añosas y con poca frecuencia en sujetos jóvenes. Una explicación probable para esta situación es: si la tasa de remodelación ósea lo permite, el tejido óseo tiene factores endógenos (genéticos, hormonales) y exógenos (dieta, actividad física) que pueden compensar las variables de la salud ósea. Las consecuencias del déficit de vitamina D sobre la salud ósea aún no se conocen completamente.

MicroRNA en enfermedades autoinmunes / MicroRNA in autoimmune diseases

Resumen Los microRNA (miRNA) son pequeños RNA no codificantes de aproximadamente 17 a 24 nucleótidos de longitud, los cuales se unen complementaria y principalmente en las regiones 3' UTR (región no traducida) de diversos RNA mensajeros (mRNA, messenger RNA). Su función general es regular negativamente la expresión génica a nivel postranscripcional, inhibiendo la traducción. Perfiles de expresión de miRNA alterados han sido identificados en diferentes líquidos, células y tejidos humanos afectados con diversas enfermedades autoinmunes y algunos se han propuestos potencialmente como biomarcadores de diagnóstico, pronóstico, actividad, etcétera, en estas patologías. Adicionalmente, variantes comunes del genoma humano, denominados polimorfismos de un solo nucleótido (SNP, single nucleotide polymorphisms) localizados en genes de miRNA han sido asociados con susceptibilidad, gravedad, y actividad en estas enfermedades. El objetivo de esta revisión es describir la biogénesis de los miRNA, su función, así como los perfiles de expresión y SNP en genes de miRNA asociados con diversas enfermedades autoinmunes, incluyendo tiroiditis autoinmune (tiroiditis de Hashimoto y enfermedad de Graves), lupus eritematoso sistémico, artritis reumatoide y síndrome de Sjögren primario.

Abstract MicroRNAs (miRNAs) are small non-coding RNAs of approximately 17-24 nucleotides in length, which complementarily and mainly bind in 3' UTR (untranslated region) regions of different messenger RNAs (mRNAs). Their general function is to negatively regulate gene expression at the posttranscriptional level, thus inhibiting translation. miRNA abnormal expression profiles of have been found in different human fluids, cells and tissues affected by different autoimmune diseases, and some of them have been proposed as potential biomarkers of diagnosis, prognosis, activity etc. in these pathologies. In addition, common variants of the human genome, called single-nucleotide polymorphisms (SNPs), located within miRNA genes, have been associated with susceptibility, severity and activity in these diseases. The purpose of this review is to describe miRNA biogenesis and function, as well as the expression profiles and SNPs in miRNA genes that are associated with different autoimmune diseases, including autoimmune thyroiditis (HashimotoMs thyroiditis and Gravess disease), systemic lupus erythematosus, rheumatoid arthritis and primary Sjögren's syndrome.

Aplicación farmacogenómica de los genes CYP2C19, CYP2C9 y VKORC1 implicados en el metabolismo de los fármacos clopidogrel y warfarina / Pharmacogenomic application of the CYP2C19, CYP2C9 and VKORC1 genes implicated in the metabolism of clopidogrel and warfarin

Resumen El estudio de las variaciones de las secuencias de ADN y ARN en relación con la respuesta a diferentes fármacos, se ha convertido en un área de estudio particularmente prometedora para la aplicación en genómica clínica y estudios de genomas personalizados. Medicamentos de uso diario en el tratamiento de enfermedades cardiovasculares han demostrado variaciones en la respuesta en función de las variantes genéticas de los individuos. Dos fármacos han concentrado el interés mundial: la warfarina, un anticoagulante oral, y el clopidogrel, un antiagregante plaquetario, los cuales actúan alterando diferentes vías que conforman la cascada de la coagulación, ya sea limitando directamente la producción de trombina o bloqueando otros activadores de la ruta. Los cambios genéticos que se han asociado a la reducción de la actividad enzimática de estos fármacos ocurren en los genes, CYP2C19 para clopidogrel y CYP2C9 y VKORC1 para warfarina. Las variaciones genéticas identificadas para estos genes se relacionan con perfiles genotípicos que determinan la dosis requerida para el paciente. Es allí donde ciencias como la farmacogenómica tienen como fin brindar una ayuda diagnóstica más objetiva al optimizar tiempo y recursos, así como disminuir el riesgo del paciente a sufrir complicaciones que comprometan su vida.

Abstract The study of the variations in DNA and RNA sequencing as regards the response to different drugs has become a particularly promising area for their application in clinical genomics and personalised genome studies. Drugs of daily use in the treatment of cardiovascular diseases have shown variations in the response depending on the genetic variations of the individuals. Two drugs have gathered worldwide interest: warfarin, an oral anticoagulant, and clopidogrel, an antiplatelet drug, which act by altering different pathways that constitute the clotting cascade either by directly limiting the production of thrombin, or by blocking other activators of the pathway. The genetic changes that have been associated with the reduction in the enzyme activity of these drugs occur in the genes, CYP2C19 for clopidogrel, and the genes, CYP2C9 and VKORC1 for warfarin. The genetic variations identified for these genes are associated with genotype profiles that determine the dose required by the patient. It is from there, sciences like pharmacogenomics have as their aim to provide a more objective diagnostic aid in order to optimise time and resources, as well as to reduce the risk of the patient suffering complications that may compromise their life.

Factores que participan en la interacción huésped-agente patógeno en el riesgo de Linfoma de Hodgkin inducido por el virus Epstein Barr / Factors involved in host-pathogen interaction for the risk of Hodgkin lymphoma induced by Epstein Barr virus

El linfoma de Hodgkin (LH) es una neoplasia del sistema linfático. La incidencia mundial anual del LH es de 3-10/100,000 habitantes. El mecanismo mediante el cual se lleva a cabo la transformación celular no es completamente claro; sin embargo, algunas evidencias parecen indicar que ciertos virus oncogénicos como el virus Epstein Barr (VEB), pueden tener alto impacto en la patogénesis de la linfoproliferación. También algunos factores genéticos y ambientales pueden estar involucrados, pues se ha encontrado una alta incidencia de casos de LH entre individuos de una misma familia que comparten características genéticas y conviven en un mismo ambiente. En México se han realizado estudios encaminados a conocer la prevalencia del VEB en pacientes con LH y se ha encontrado la presencia de este virus hasta en el 64,2%. El VEB ha sido detectado en las Células Reed Sternberg (CRS) y en Células de Hodgkin (CH) en el 50% de los casos de LH clásico. No se ha dado hasta ahora una explicación satisfactoria, pero se ha propuesto que la variabilidad geográfica y la variabilidad inmunológica desempeñan un papel determinante en la positividad del VEB en LH. A pesar de los avances que hasta ahora se tienen, no existen suficientes evidencias que permitan establecer una clara asociación entre los factores del huésped, el medio ambiente y el agente patógeno en el riesgo de la linfoproliferación que conduce al desarrollo de LH. La presente revisión tiene como objetivo analizar algunos de los factores de riesgo que influyen durante la interacción huésped, agente patógeno y medio ambiente en la etiología del LH.

Hodgkin lymphoma (HL) is a neoplasm characterized by malignant cells called Reed Sternberg and Hodgkin’s cells in the lymphatic system. Such cells comprise 1% of the tumor while the remainder is made up of lymphocytes, histiocytes, eosinophils and plasma non-neoplastic cells. The annual global incidence of HL is 3-10/100,000 inhabitants and is most commonly found in young adults. The mechanism by which cell transformation is accomplished is not entirely clear; however, some evidences suggest that oncogenic viruses like the Epstein Barr virus (EBV) may have a high impact on the pathogenesis of lymphoproliferation. Genetic and environmental factors could be involved, since it has been found a high incidence of HL among members of the same family. In Mexico, there have been studies to determine the prevalence of EBV in patients with HL and found the presence of this virus in up to 64.2% of the cases. EBV has been detected in the Reed Sternberg cells and Hodgkin cells in 50% of cases of classical HL. There is not a satisfactory explanation for this, but it has been proposed that geographic and immunological variabilities play a role in the positivity of EBV in HL. However, despite recent advances in the field, there is insufficient evidence to show a clear association between host factors, environment and pathogens, and the risk of lymphoproliferation leading to the development of HL. This review aims to give an overview about the risk factors that influence the interaction of host, pathogens and environment in the etiology of HL.